《绝妙侦探☆迷宫》的故事舞台坐落于被飞速发展的时代遗忘的角落——旧都·东京，这里街巷留存着复古余韵，交错的暗巷与老旧建筑间频发各类超脱常识、荒诞诡谲的异色案件，被统称为“梦幻事件”。年方11岁的美型少年日向真行居于旧都深处的宅邸，与沉稳可靠的管家晴岚、活泼贴心的女仆初实共同生活。年纪尚幼的他身具寄宿而来的神秘能力“神智”，能穿透层层迷雾感知事件背后的真相，三人组成的侦探组合奔走于旧都各色案发现场，破解一桩桩裹挟着世人欲望、执念与旧城秘闻的离奇事件，而在接连探案的过程中，与“神智”来源、日向家尘封过往相关的深层秘密，也随着他们的探查渐渐浮出水面。
