《独水清莲》故事发生在江南独水河流域，养莲世家出身的少女沈清莲原本和父亲守着百亩祖传莲田，靠采莲、制藕粉过着平静日子，却遭觊觎漕运私道的官绅勾结构陷：父亲被诬通匪投河自尽，莲田被强占，沿岸数十户莲农也被夺了生计。为报父仇、替乡邻讨公道，沈清莲揣着半年来收集的罪证拦轿鸣冤，巧遇奉命暗查江南漕运贪墨案的年轻按察佥事陆珩。起初两人因身份悬殊互相戒备：沈清莲不信官府真能为平民做主，陆珩也忌惮这个烈性姑娘会不会是贪腐集团抛出的诱饵，直到几番共历莲荡躲追杀、莲籽传密信的生死时刻，才放下猜忌联手查案，最终凑齐官商分赃的铁证，掀翻横跨府县两级的贪腐网络，帮莲农讨回了田产。结案后沈清莲拒绝随陆珩回京的邀约，留在独水河牵头办起莲业合作社，等陆珩主动请调出任当地知府时，千亩莲塘正开得接天连云。
